La combinación única de MALDI y QIT permite la generación de iones utilizando un número de diferentes matrices; la conmutación entre los modos de ionización positivo y negativo en segundos; selección simple del ión precursor de alta resolución para experimentos MSn y fragmentación MSn controlable.
La incorporación de un analizador TOF promueve alta resolución y alta precisión de masa en todos los iones generados con independencia de su origen.
Permite que los iones provenientes de mezclas abundantes y complejas o sobres interferencias isobáricas estrechamente asociados al analito en cuestión, ser fácilmente aislados por atrapamiento y posteriormente fragmentado; logrando resoluciones superiores a 1000 FWHM y así facilitar el análisis de analitos con interferencias de masa nominal similares.